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公司补缴个人所得税税款的步骤是：第一做好补缴个人所得税的申报表，第二将申报表提交给税务局，税务局会出具通用缴款书，第三收到银行缴纳税款，等3至5天就可以出具完税证明。关于补税的流程以及什么情况下需要补税可以看看公司怎么帮员工补报汇算清缴后的税款这篇文章。

公司给员工补报个税的流程

1、做好补缴个人所得税的申报表;

2、将申报报表提交到税务局，由税务局出具通用缴款书;

3、最后到银行去进行缴税，缴完税3-5天即可出具完税证明。

哪些情况需要办理个人所得税综合所得汇算清缴补税

补税是纳税人的义务。如果纳税人年度预缴税额低于应纳税额的，且不符合国务院规定豁免汇算义务情形的(综合所得年度收入不超过12万元或者补税金额不超过400元的)，均应当办理年度汇算补税。常见情形有：

一、在两个以上单位任职受雇并领取工资薪金，预缴税款时重复扣除了基本减除费用(5000元/月)或全年综合所得收入加总后，导致适用综合所得年税率高于预扣率;

二、年度内更换任职受雇单位，全年综合所得收入加总后，导致适用综合所得年税率高于预扣率;

三、除工资薪金外，还有劳务报酬、稿酬、特许权使用费，各项综合所得的收入加总后，导致适用综合所得年税率高于预扣率;

四、预扣预缴时扣除了不该扣除的项目，或者扣除金额超过规定标准，年度合并计税时因调减扣除额导致应纳税所得额增加;

五、纳税人取得综合所得，因扣缴义务人未依法申报收入并预扣预缴税款，需补充申报收入等。

补税是纳税人的义务，一般遇到重复扣除6万元，导致年税率高于预扣率会补税，还有扣除了不改扣除项目导致应纳税所得额增加，也需要补缴税款，达到这样的结果基本都需要补税，对文中的内容有什么不懂的可以点击公司怎么帮员工补报汇算清缴后的税款的内容领取个税汇算清缴资料包!