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这种情况属于典型的“公司+加工点”模式，税务合规的关键在于明确两个地址间的法律关系与业务流程，并确保发票流、资金流、货物流“三流一致”。以下是核心操作建议：

1. **明确加工厂的法律地位**：这是首要问题。加工厂（地址B）必须取得合法经营资质。
* **最佳方案**：将加工厂注册为贸易公司的**分公司**（非独立核算）。这样，加工厂可以作为贸易公司的一个生产车间，其所有经营活动均以贸易公司名义进行。
* **备选方案**：如果独立运营，则需注册为**个人独资企业、个体工商户或另一家公司**，与贸易公司形成委托加工关系。

2. **基于不同法律地位的合规操作**：
* **若加工厂注册为分公司**：
* **发票**：原材料供应商直接将发票开给贸易公司（抬头为总公司），这是完全合规的。
* **物流**：原材料可直送加工厂（B地址），在内部单据上注明即可。
* **成本核算**：贸易公司在账务上统一核算原材料、加工成本（如人工、水电等，由分公司报销或总公司直接支付），最终形成产成品成本。**购入材料与销售成品在总公司层面是匹配的**。
* **若加工厂注册为独立主体（委托加工关系）**：
* **发票流**：原材料发票开给贸易公司。贸易公司需要与加工厂签订明确的《委托加工合同》。
* **加工费发票**：加工厂完成加工后，应向贸易公司开具“加工费”发票。
* **物流与所有权**：原材料由贸易公司“委托”加工厂进行加工，原材料及产成品的所有权均属于贸易公司。这样，贸易公司“购入”原材料，“委托加工”后形成成品再销售，链条完整。

3. **必须避免的做法**：绝不可让加工厂（无照）直接以自己名义采购原材料或销售产品。这会导致贸易公司账务严重脱节，涉嫌虚开发票、偷逃税款，风险极高。

**总结行动步骤**：立即为加工厂（地址B）办理营业执照，首选设为分公司。如设为独立主体，则务必签订委托加工合同，并确保取得加工费发票。在此框架下，原材料发票直接开给贸易公司是合规的。