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分公司是属于总公司的分支机构，虽可以独立开展业务活动，但只能在公司授权范围内以总公司分支机构的名义从事经营活动，且不具有法人资格，无独立的名称、公司章程和组织机构。子公司由母公司决定重大决策或人事安排，但可以独立开展业务活动，独立承担公司行为所带来的一切后果和责任，并具有法人资格，拥有独立的名称、公司章程和组织机构。

选择子公司或分公司，主要需要考虑以下三大方面：

1.法律主体的风险问题

正如我们前面所说的，子公司具有独立法人资格，可以独立承担民事责任。母公司作为子公司的最大股东，仅以其对子公司的出资额为限对子公司在经营活动中的债务承担责任；

而分公司不具有法人资格，无独立法律地位，不独立承担民事责任，并没有属于自己的独立财产，与总公司是统一核算的，因此其经营活动中的负债由总公司负责清偿，即以总公司全部资产对分公司在经营中的债务承担责任。

从法律主体是否有独立法人资格来看，母子公司之间存在风险隔离，而总分公司则是“一荣俱荣，一损俱损”的命运共同体了。

2.企业管理问题

企业管理是有成本的，而成本管控是保障企业利润的关键因素，下面我们就从管理成本角度看一下总分公司和母子公司之间的区别：

1）分公司在设立和注销环节的流程均较为简单，耗费较低;

2）如果企业从事行业需要办理资质，这时由于分公司是非独立法人资格所以它可以和总公司共用资质，而子公司由于是独立法人则需要重新办理资质。

此时显然设立分公司的成本相对较低。

3）注册分公司没有注册资本的要求，而子公司则需要注册资本，并且要求实缴。

4）总分公司之间其实可以说原本就是一个主体，分公司就相当于在某地设立的一个办事处，可以和总公司适用的相同的企业文化和管理制度，因此在管理上会更加高效方便；

而子公司则不同，子公司为独立法人，有自己的公司章程、董事会、企业文化和规章制度，因此对于母子公司来说在管理上有更大的独立性和自由性。

举个例子，如果业务跨度较大，比如一家重工业和一家游戏传媒公司，适用相同的章程和规章制度就有点奇奇怪怪的，分开设立子公司相对较好些。

3.财税处理

财税处理方面，子公司和分公司也存在不小的区别。

首先在财务核算方面，由于子公司属于独立法人，所以母公司和子公司之间只能选择独立核算，不需要将数据汇总到母公司做合并，而总公司和分公司之间既可以选择独立核算也可以选择非独立核算。

在财务核算上，总分公司之间核算选择更自由但人工成本可能会更高一些。

具体到增值税和企业所得税处理方面，分公司和子公司就有些讲究了。

增值税方面两者基本没有什么差异，增值税是向所在地的主管税务机关申报纳税，也就是说，分公司是独立的增值税纳税主体，独立适用增值税优惠政策，无论分公司还是子公司在500万以内都可以适用增值税小规模纳税人的优惠政策。

企业所得税方面，分公司和子公司的差异就相当大了。

在流程上，子公司企业所得税属于独立核算独立申报，而分公司则需要与总公司一并汇总纳税，于是这里就产生了两个较大的差异之处：

1）子公司可以独立享受小微企业的企业所得税优惠，而分公司必须与母公司汇总后才能确定是否满足小微企业条件，无形中提高了优惠的适用难度。

2）子公司企业所得税为独立申报，处理起来相对简单。分公司在企业所得税上需要与总公司汇总纳税，简单说就是分公司每个季度末将本季度的财务数据上报总公司，由总公司进行数据汇总，然后再根据：“营业收入、职工薪酬、资产总额”三因素占比在总分公之间进行税金分配，最后各个总分公司之间根据各自分摊金额进行纳税。

分公司因汇总而明显提高了财务部门的工作难度和工作量。不过相应的，总分公司的盈利和亏损能够相互抵扣，而母子公司的亏损只能由自己找补。

子公司和分公司在主体风险、企业管理和财税处理三个方面存在较大差异。

所以说，究竟是设立子公司还是分公司，还是要具体情况具体分析。